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蛋白質的理論同位素峰預測及質量分析
項目類別:理工科實習科研
招生名額:20人
適合群體:大學生
活動時間:常年招生
立即報名
(報名前還有疑問? 歡迎致電客服:010-57952000)

項目地點:

遠程

項目目的:

本項目將會帶領學生認識和了解計算技術在生物學研究中發揮的重要作用,并以來自實際的科研問題驅動為例,如以蛋白質的理論同位素峰計算預測,質譜數據的解析與對接為例。

項目費用:

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  一、項目簡介

  隨著基因組學與蛋白質組學最近幾年的火熱發展,對于基因與蛋白大數據的計算處理成為一個重要的研究課題,生物信息學的一個重要發展方向。特別是發達國家,如美國,加拿大,瑞士,荷蘭,德國等國家的大學,都開設了生物信息學的這方面的專業,研究課題和面向應用的項目。如瑞士的Uniprot 蛋白質數據庫成為生物學研究的基礎。對于大規模蛋白質的測序研究將成為基因測序之后備受重視的產業化前課題。在鑒定大規模的蛋白質問題中,一個首要的問題是通過蛋白質的質量來篩選,進而鑒定蛋白質。目前,已經可以通過高精度,高分辨率的質譜技術來實現。對于一個蛋白質,如何有效地利用它的質譜數據,并通過與理論預測相結合,是當前生物信息學中一個重要的計算課題。

  二、項目內容

  本項目將會帶領學生認識和了解計算技術在生物學研究中發揮的重要作用,并以來自實際的科研問題驅動為例,如以蛋白質的理論同位素峰計算預測,質譜數據的解析與對接為例。對于數據庫提供的任何物種的蛋白質序列數據庫,可以通過emass 算法計算出其理論的同位素分布,進而與質譜測量的進行比較分析。

  本科研實訓項目專門為計劃申請計算機應用,生物學(生物信息學方向),計算生物學,軟件工程等專業的學生所設計。實習結束后,導師會根據學生表現出具推薦信。

  三、師資背景

  指導老師獲得過國家留學基金委的資助,在美國著名大學從事合作研究一年,了解美國高校的運行與科研體制,現在任職于國內生命科學頂級研究所,為計算機應用(生物信息學)副研究員。所開發的生物信息學算法已在重要國際期刊發表,并得到國內外用戶的下載使用。目前在研課題經費80 萬元(國家自然科學基金),并與美國的著名高校保持交流與合作。

  四、招生對象及要求

  大二以上優秀本科生(有較熟練的編程經驗,熟悉至少一門編程語言),計劃申請計算機應用、生物學(生物信息學方向)、計算生物學、軟件工程等相關專業,為了讓學生可以更好地完成科研項目,項目組會以面試形式對學生進行篩選。

  五、項目關鍵點

  a) 這個項目能夠培養學生什么素質和能力?

  通過導師面對面指導學生完整參與一個科研實訓項目,激發學生對生物信息學和生物數據處理技術的科研興趣,培養學生參與科研項目的基本素質和實踐能力。

  b) 通過這個項目學生能夠掌握什么軟件或者具體知識?

  通過參與本項目,學生將能夠:熟練掌握并實踐自己熟悉的一門編程語言;理解emass算法的基礎;掌握蛋白質質量信息處理的方式和方法;掌握解決和提煉,解決科學問題的能力。

  c) 這個項目具體做什么應用?

  本項目會帶領學生研究一個蛋白質質量測量中的數據處理問題,該問題來自實際的科研中。通過對該問題的了解,分析與求解,建立科研的全過程訓練。

  六、項目安排

  七、報名方式

  咨詢電話:010-5795-2000

  地址:北京市海淀區中關村丹棱街3號中國電子大廈B座15層

  • 北京
  • 成都
  • 大連
  • 合肥
  • 西安
  • 武漢
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全國統一咨詢熱線:010-5795-2000 工作時間:周一至周日(8:30-21:30) 地址:北京市海淀區中關村丹棱街3號 中國電子大廈B座15層

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全國統一咨詢熱線:010-5795-2000 工作時間:周一至周日(8:30-21:30) 地址:大連沙河口區黃河路620號現代服務業總部大廈19層 C2D1

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西安分公司

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武漢分公司

全國統一咨詢熱線:010-5795-2000 工作時間:周一至周日(8:30-21:30) 地址:武漢市洪山區珞瑜路10號群光二期寫字樓34層01-10號

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